医院的污水，除一般生活污水外，还含有化学物质、废水和。因此，必须经过处理后才能排放，特别是肝炎等传染病病房排出来的污水，须经消毒后才可排放。无集中式的医院，对有传染性的粪便，必须单独消毒使其。常用消毒剂有、、、。对含放射性的污水，应按同位素处理要求处理。在处理过程中，沉淀的污泥含有大量的细菌、病毒和寄生虫卵，须经消毒（常用熟石灰消毒）或后方可用作肥料。
导流曝气生物滤池利用滤料切割、阻挡、细碎气泡，强化气、液传质效应，增加微生物与空气的接触面积和时间，大大提高充氧率，减小耗电功率，因此运转费用经济性。罗茨风机满足曝气池的用氧量，达到排污标准。